玉米黑条矮缩病从幼苗到结实期均能发病。幼苗期发病，开始从心叶中脉两侧中部产生透明的点线状斑点，逐渐扩展到全叶，以后病变起蜡白色小点，有触手感觉，叶色浓绿，节间缩短，病株明显矮化，不能抽穗结实，往往提早枯死，在10叶期左右发病时，新生的叶片浓绿，叶背出现蜡白色突起条斑，上部茎节缩短，虽能抽穗结实，但雄蕊长轴短缩，雌蕊小或畸形，植株后期得病症状不明显，但也造成减产，叶鞘和苞叶上显现的白条斑与叶片症状相同。